يضم المجلد الثالث من( الاتقان في علوم القرآن)، 21 نوعاً علمياً من أنواع علوم القرآن الـ80(من النوع 43 إلى النوع 63)، وتتركز مادتها حول القواعد الدلالية والأصولية لاستنباط المعاني والتفسير، والعلوم البلاغية والبيانية، والنظم الفني والبناء البلاغي للسور والآيات.
أبرز المحاور الموضوعية التي ينطوي عليها المجلد:
المباحث الدلالية والأصولية(الأنواع 43 - 51): وتشمل دراسة المحكم والمتشابه، الناسخ والمنسوخ، العام والخاص، المجمل والمبين، المطلق والمقيد، المنطوق والمفهوم، ومشكل القرآن وموهم الاختلاف.
البلاغة القرآنية وعلم البيان والبديع(الأنواع 52 - 58): وتتناول الحقيقة والمجاز، التشبيه والاستعارات، الكناية والتعريض، الحصر والاختصاص، الإيجاز والإطناب، والخبر والإنشاء، وبدائع القرآن.
التناسب والبناء النظمي للسور والآيات(الأنواع 59 - 63): وتهتم بفواصل الآي، فواتح وخواتم السور، التناسب بين الآيات والسور، والآيات المشتبهات(المتشابه اللفظي).